28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13700 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_13700  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1662  hypothetical protein  50.38 
 
 
290 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.579464  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1345  hypothetical protein  49.61 
 
 
276 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2028  hypothetical protein  48.86 
 
 
307 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.653439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6053  hypothetical protein  49.29 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2008  hypothetical protein  47.06 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0992003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3144  hypothetical protein  53.51 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0152673  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2352  hypothetical protein  48.47 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.267744  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1129  hypothetical protein  44.53 
 
 
300 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22100  hypothetical protein  46.69 
 
 
306 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00612076  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2045  hypothetical protein  36.54 
 
 
289 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.425713  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4434  hypothetical protein  40.77 
 
 
288 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702856  normal  0.182429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1684  putative glycosyltransferase  31.46 
 
 
275 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416881  hitchhiker  0.0067809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1313  hypothetical protein  27.41 
 
 
273 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5414  hypothetical protein  40.74 
 
 
469 aa  98.6  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1916  hypothetical protein  43.26 
 
 
288 aa  98.6  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329746  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1091  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000523541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0594  hypothetical protein  34.1 
 
 
265 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1388  hypothetical protein  37.84 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2174  hypothetical protein  46.22 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000774665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3085  hypothetical protein  42.38 
 
 
276 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3022  hypothetical protein  49.6 
 
 
236 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.338405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3005  hypothetical protein  41.4 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196318  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1907  hypothetical protein  42.79 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0386979  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1550  hypothetical protein  30.85 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06630  hypothetical protein  33.17 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80482e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1611  hypothetical protein  36.16 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1449  hypothetical protein  37.5 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>