29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3144 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3144  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0152673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1662  hypothetical protein  52.27 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.579464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1345  hypothetical protein  53.23 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2028  hypothetical protein  54.37 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.653439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5414  hypothetical protein  51.74 
 
 		 469 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2008  hypothetical protein  52.69 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0992003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6053  hypothetical protein  48.45 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22100  hypothetical protein  50.38 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2352  hypothetical protein  51.32 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.267744  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2174  hypothetical protein  48.11 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000774665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3005  hypothetical protein  52.13 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196318  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13700  hypothetical protein  47.79 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1129  hypothetical protein  44.94 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3022  hypothetical protein  55.78 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.338405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4434  hypothetical protein  44.79 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702856  normal  0.182429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1916  hypothetical protein  48.98 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329746  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1907  hypothetical protein  51.02 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0386979  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2045  hypothetical protein  34.93 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.425713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000523541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1550  hypothetical protein  32.84 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1388  hypothetical protein  39.62 
 
 		 274 aa  92  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1313  hypothetical protein  29.47 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0594  hypothetical protein  30.53 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06630  hypothetical protein  32.06 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80482e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1611  hypothetical protein  40.83 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1684  putative glycosyltransferase  29.21 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416881  hitchhiker  0.0067809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3085  hypothetical protein  38.57 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1449  hypothetical protein  40.21 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  25.24 
 
 		 330 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>