28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1907 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1907  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0386979  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1916  hypothetical protein  89.93 
 
 
288 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329746  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3005  hypothetical protein  53.96 
 
 
308 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4434  hypothetical protein  53.71 
 
 
288 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702856  normal  0.182429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1662  hypothetical protein  50.2 
 
 
290 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.579464  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2028  hypothetical protein  49.81 
 
 
307 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.653439  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1345  hypothetical protein  44.27 
 
 
276 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3144  hypothetical protein  49.24 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0152673  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6053  hypothetical protein  47.99 
 
 
287 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2174  hypothetical protein  52.76 
 
 
304 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000774665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2352  hypothetical protein  47.55 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.267744  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5414  hypothetical protein  45.72 
 
 
469 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3022  hypothetical protein  50 
 
 
236 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.338405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22100  hypothetical protein  47.02 
 
 
306 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00612076  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2008  hypothetical protein  50.92 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0992003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13700  hypothetical protein  42.7 
 
 
269 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1313  hypothetical protein  26.89 
 
 
273 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1129  hypothetical protein  41.16 
 
 
300 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1091  hypothetical protein  32.54 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000523541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1550  hypothetical protein  25.68 
 
 
270 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2045  hypothetical protein  33.96 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.425713  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1388  hypothetical protein  36.19 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0594  hypothetical protein  32.69 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06630  hypothetical protein  30.33 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80482e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3085  hypothetical protein  36.24 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1684  putative glycosyltransferase  30.59 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416881  hitchhiker  0.0067809 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1611  hypothetical protein  44.06 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1449  hypothetical protein  36.92 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>