38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1091 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1091  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000523541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2045  hypothetical protein  48.77 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.425713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1611  hypothetical protein  49.62 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1388  hypothetical protein  43.25 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0594  hypothetical protein  42.58 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1550  hypothetical protein  40.88 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1684  putative glycosyltransferase  34.35 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416881  hitchhiker  0.0067809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06630  hypothetical protein  36.22 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80482e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1313  hypothetical protein  31.37 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1345  hypothetical protein  36.22 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6053  hypothetical protein  38.22 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1662  hypothetical protein  34.31 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.579464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2028  hypothetical protein  36.56 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.653439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3144  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0152673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3085  hypothetical protein  30.62 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2352  hypothetical protein  33.17 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.267744  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13700  hypothetical protein  32.02 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1916  hypothetical protein  33.01 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329746  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1907  hypothetical protein  32.2 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0386979  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3005  hypothetical protein  31.58 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2174  hypothetical protein  31.97 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000774665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2008  hypothetical protein  36.73 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0992003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5414  hypothetical protein  36.17 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4434  hypothetical protein  33.82 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702856  normal  0.182429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1129  hypothetical protein  32.67 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3022  hypothetical protein  34.57 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.338405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22100  hypothetical protein  32.83 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1449  hypothetical protein  27.82 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371989  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1266  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  27.03 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1241  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  27.03 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0247  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0890028  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0401  glycosyl transferase family 4  26.47 
 
 		 379 aa  45.8  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4010  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.57 
 
 		 360 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2002  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  34.81 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0747  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  25.88 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0126585  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  28.23 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4002  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.42 
 
 		 373 aa  42.7  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.0143108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1290  glycosyl transferase family 4  27.04 
 
 		 372 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>