28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1129 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1129  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1345  hypothetical protein  53.31 
 
 
276 aa  224  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1662  hypothetical protein  57.54 
 
 
290 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.579464  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22100  hypothetical protein  53.71 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00612076  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2028  hypothetical protein  46.88 
 
 
307 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.653439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3144  hypothetical protein  46.42 
 
 
286 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0152673  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2352  hypothetical protein  52.53 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.267744  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3022  hypothetical protein  50.21 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.338405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5414  hypothetical protein  44.06 
 
 
469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6053  hypothetical protein  44.11 
 
 
287 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.880761  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13700  hypothetical protein  42.75 
 
 
269 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3005  hypothetical protein  43.15 
 
 
308 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4434  hypothetical protein  41.57 
 
 
288 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702856  normal  0.182429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2008  hypothetical protein  43.12 
 
 
317 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0992003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2174  hypothetical protein  42.35 
 
 
304 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000774665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1916  hypothetical protein  42.86 
 
 
288 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329746  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1313  hypothetical protein  29.08 
 
 
273 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1091  hypothetical protein  32.53 
 
 
278 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000523541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1907  hypothetical protein  45.93 
 
 
288 aa  99  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0386979  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1550  hypothetical protein  35.75 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0594  hypothetical protein  30.86 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1684  putative glycosyltransferase  32.35 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.416881  hitchhiker  0.0067809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1388  hypothetical protein  34.12 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2045  hypothetical protein  36.5 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.425713  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3085  hypothetical protein  38.97 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1611  hypothetical protein  39.52 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06630  hypothetical protein  30.2 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80482e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1449  hypothetical protein  37.02 
 
 
258 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>