37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1395 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1395  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1114  hypothetical protein  58.96 
 
 
138 aa  164  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883166  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1004  hypothetical protein  59.7 
 
 
138 aa  164  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.416279  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0492  hypothetical protein  47.52 
 
 
152 aa  140  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.727699  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  38.14 
 
 
360 aa  80.1  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5003  asch domain superfamily  33.9 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35920  hypothetical protein  31.5 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0260  hypothetical protein  31.36 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1166  protein of unknown function DUF437  34.62 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.320751  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0311  asch domain superfamily  33.05 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1659  hypothetical protein  31.3 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1771  hypothetical protein  31.3 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0088  protein of unknown function DUF437  32.03 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2538  hypothetical protein  30.83 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0928  hypothetical protein  30.36 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.349962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2104  hypothetical protein  34.29 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223798 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1005  hypothetical protein  36.96 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000462083  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1735  hypothetical protein  29.06 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0385  hypothetical protein  30.63 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0343  hypothetical protein  30.63 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4712  hypothetical protein  27.94 
 
 
134 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06553  hypothetical protein  30.63 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0390  hypothetical protein  30.63 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0233  hypothetical protein  29.17 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000672  hypothetical protein  27.68 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.11314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1615  protein of unknown function DUF437  30.36 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.474283  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1042  hypothetical protein  34.95 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2695  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.432251  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0247  hypothetical protein  30.38 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1901  hypothetical protein  26.96 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.623364  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4433  putative cytoplasmic protein  26.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4596  hypothetical protein  26.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4520  hypothetical protein  26.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114394  normal  0.196028 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4523  putative cytoplasmic protein  26.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4398  putative cytoplasmic protein  26.09 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.430337  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1903  hypothetical protein  27.59 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1415  protein of unknown function DUF437  29.41 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.849897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>