16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1903 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1903  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  346  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  31.25 
 
 		 360 aa  64.7  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1166  protein of unknown function DUF437  32.03 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.320751  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000672  hypothetical protein  29.36 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.11314  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06553  hypothetical protein  27.93 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2538  hypothetical protein  28.8 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1395  hypothetical protein  27.27 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0492  hypothetical protein  31.11 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.727699  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0088  protein of unknown function DUF437  28.46 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35920  hypothetical protein  28.69 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1615  protein of unknown function DUF437  26.61 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.474283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1901  hypothetical protein  23.81 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.623364  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1146  hypothetical protein  27.13 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.855253  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5003  asch domain superfamily  22.43 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1005  hypothetical protein  27.12 
 
 		 148 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000462083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0260  hypothetical protein  21.5 
 
 		 152 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>