34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1114 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1114  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  276  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883166  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1004  hypothetical protein  92.75 
 
 		 138 aa  258  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.416279  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1395  hypothetical protein  58.96 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0492  hypothetical protein  44.7 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.727699  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35920  hypothetical protein  37.01 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  40.68 
 
 		 360 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2104  hypothetical protein  36.36 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223798 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1166  protein of unknown function DUF437  39.69 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.320751  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1659  hypothetical protein  32.56 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1771  hypothetical protein  32.56 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0928  hypothetical protein  28.12 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.349962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1005  hypothetical protein  37.23 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000462083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5003  asch domain superfamily  29.66 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4712  hypothetical protein  33.67 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2695  hypothetical protein  34.44 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.432251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0260  hypothetical protein  29.66 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0233  hypothetical protein  33.06 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0311  asch domain superfamily  29.66 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0088  protein of unknown function DUF437  33.07 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06553  hypothetical protein  30.28 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2538  hypothetical protein  35.85 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1735  hypothetical protein  33.72 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0343  hypothetical protein  32.61 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0385  hypothetical protein  32.61 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0390  hypothetical protein  32.61 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1901  hypothetical protein  28.44 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.623364  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1042  hypothetical protein  32.08 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.11314  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4433  putative cytoplasmic protein  34.07 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4596  hypothetical protein  34.07 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4398  putative cytoplasmic protein  33.7 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.430337  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4520  hypothetical protein  34.07 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114394  normal  0.196028 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4523  putative cytoplasmic protein  34.07 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1615  protein of unknown function DUF437  29.27 
 
 		 154 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.474283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>