37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0233 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  278  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4712  hypothetical protein  72.66 
 
 		 134 aa  204  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4520  hypothetical protein  53.54 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114394  normal  0.196028 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4523  putative cytoplasmic protein  53.54 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4433  putative cytoplasmic protein  53.54 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4596  hypothetical protein  53.54 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4398  putative cytoplasmic protein  52.76 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.430337  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2695  hypothetical protein  57.89 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.432251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0390  hypothetical protein  48.82 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0385  hypothetical protein  48.03 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0343  hypothetical protein  48.03 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1659  hypothetical protein  43.31 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1771  hypothetical protein  43.31 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  47.11 
 
 		 360 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1146  hypothetical protein  46.03 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.855253  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2104  hypothetical protein  39.85 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223798 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1005  hypothetical protein  49.11 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000462083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0260  hypothetical protein  42.65 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1166  protein of unknown function DUF437  45.38 
 
 		 180 aa  104  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.320751  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5003  asch domain superfamily  39.71 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0311  asch domain superfamily  38.97 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2538  hypothetical protein  43.44 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0928  hypothetical protein  40.16 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.349962  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1901  hypothetical protein  42.11 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.623364  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1042  hypothetical protein  39.02 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06553  hypothetical protein  37.72 
 
 		 171 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35920  hypothetical protein  39.67 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000672  hypothetical protein  39.47 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.11314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1735  hypothetical protein  40.5 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1615  protein of unknown function DUF437  37.5 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.474283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0088  protein of unknown function DUF437  34.71 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0247  hypothetical protein  38.1 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.727699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1395  hypothetical protein  29.17 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1114  hypothetical protein  33.06 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883166  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1004  hypothetical protein  30.83 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.416279  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1415  protein of unknown function DUF437  32.52 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.849897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>