More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3968 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3968  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 		 286 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6070  inositol monophosphatase  69.88 
 
 		 283 aa  349  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.712503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0295  inositol monophosphatase  55.51 
 
 		 487 aa  276  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1604  inositol-phosphate phosphatase  50.57 
 
 		 290 aa  258  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4316  inositol-phosphate phosphatase  46.61 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.866309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3411  Inositol-phosphate phosphatase  43.13 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  40.42 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  39.58 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  40 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  38.55 
 
 		 267 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  42.79 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0186  inositol-phosphate phosphatase  38.94 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  39.33 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  39.33 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  39.33 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  39.75 
 
 		 267 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  39.75 
 
 		 267 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  39.75 
 
 		 267 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  39.75 
 
 		 267 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  44.5 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  38.91 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  38.49 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  38.4 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1579  inositol-phosphate phosphatase  41.48 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0271512  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6136  inositol monophosphatase  44.39 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474979  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  38.75 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1636  extragenic supressor  41.48 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  38.33 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  38.33 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  38.33 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  38.33 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  38.33 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  38.33 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  35.68 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  38.33 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  38.33 
 
 		 267 aa  165  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  37.92 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  37.92 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  37.92 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  37.92 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  37.92 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  37.55 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  38.3 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  37.92 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  39.09 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0717  inositol monophosphatase family protein  37.16 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  38.22 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0278  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.34 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0673  inositol monophosphatase family protein  37.16 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  41.82 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  36.51 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  36.51 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  36.51 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  37.84 
 
 		 271 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  37.5 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  37.55 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  39.66 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  38.93 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  40.08 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.07 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000312516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  38.46 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  37.87 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.46 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  40.08 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  37.94 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3118  inositol-phosphate phosphatase  39.3 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  37.16 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0581  inositol-phosphate phosphatase  39.36 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  37.5 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2304  inositol-phosphate phosphatase  39.04 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116647 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  37.85 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.5 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  40.36 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  38.08 
 
 		 272 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  34.98 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  42.25 
 
 		 259 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  40 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0983  inositol monophosphatase  39.17 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133675  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  36.29 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1484  inositol-phosphate phosphatase  39.17 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145709  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6548  Inositol-phosphate phosphatase  40.93 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  35.32 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  41.26 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0651  putative inositol monophosphatase protein  38.25 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  41.26 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  39.91 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.1 
 
 		 267 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  36.51 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  37.77 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  38.14 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  36.63 
 
 		 270 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0888  inositol monophosphatase  41.01 
 
 		 269 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0122019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  40 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  37.71 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  37.71 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  37.1 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  39.26 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  38.64 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0412  inositol-phosphate phosphatase  38.71 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>