27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3294 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3294  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  678    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0390  hypothetical protein  36.04 
 
 
339 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.947707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4088  putative lipoprotein  32.85 
 
 
351 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03730  hypothetical protein  32.85 
 
 
351 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4121  hypothetical protein  32.85 
 
 
351 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4124  putative lipoprotein  32.85 
 
 
351 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03781  hypothetical protein  32.85 
 
 
351 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5347  putative lipoprotein  32.56 
 
 
351 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4426  putative lipoprotein  32.74 
 
 
346 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4286  putative lipoprotein  31.98 
 
 
351 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4376  putative lipoprotein  32.69 
 
 
315 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4253  hypothetical protein  31.72 
 
 
366 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4433  hypothetical protein  31.72 
 
 
366 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696771  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3293  hypothetical protein  33.23 
 
 
321 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4321  hypothetical protein  31.72 
 
 
366 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.932757  normal  0.276393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4367  hypothetical protein  31.72 
 
 
366 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4282  putative cytoplasmic protein  31.72 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2469  hypothetical protein  34.42 
 
 
354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4320  hypothetical protein  28.92 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.191931  normal  0.491467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4275  putative inner membrane lipoprotein  28.92 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4366  hypothetical protein  28.61 
 
 
343 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4431  putative inner membrane lipoprotein  28.53 
 
 
343 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362505  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4275  hypothetical protein  35.64 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6189  hypothetical protein  38.57 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02296  hypothetical protein  35.88 
 
 
134 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1342  hypothetical protein  23.43 
 
 
352 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02295  hypothetical protein  27.88 
 
 
119 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>