24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4366 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4431  putative inner membrane lipoprotein  98.83 
 
 
343 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362505  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4275  putative inner membrane lipoprotein  99.42 
 
 
343 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4366  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4320  hypothetical protein  99.42 
 
 
343 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.191931  normal  0.491467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4433  hypothetical protein  36.41 
 
 
366 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696771  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4253  hypothetical protein  36.41 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4321  hypothetical protein  36.41 
 
 
366 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.932757  normal  0.276393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4282  putative cytoplasmic protein  36.14 
 
 
366 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4367  hypothetical protein  35.87 
 
 
366 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5347  putative lipoprotein  35.85 
 
 
351 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4088  putative lipoprotein  35.57 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03730  hypothetical protein  35.57 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4121  hypothetical protein  35.57 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4124  putative lipoprotein  35.57 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03781  hypothetical protein  35.57 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4286  putative lipoprotein  36.13 
 
 
351 aa  232  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4426  putative lipoprotein  35.51 
 
 
346 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4376  putative lipoprotein  35.46 
 
 
315 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0390  hypothetical protein  29.82 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.947707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2469  hypothetical protein  32.97 
 
 
354 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3294  hypothetical protein  27.71 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3293  hypothetical protein  24.73 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4275  hypothetical protein  25.2 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6189  hypothetical protein  24.22 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.568849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>