24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4275 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4275  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2469  hypothetical protein  34.07 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0390  hypothetical protein  37.44 
 
 
339 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.947707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4426  putative lipoprotein  27.11 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4088  putative lipoprotein  28 
 
 
351 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4124  putative lipoprotein  28 
 
 
351 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4121  hypothetical protein  28 
 
 
351 aa  109  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03730  hypothetical protein  28 
 
 
351 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03781  hypothetical protein  28 
 
 
351 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4286  putative lipoprotein  27.99 
 
 
351 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5347  putative lipoprotein  27.67 
 
 
351 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4433  hypothetical protein  27.51 
 
 
366 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696771  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4367  hypothetical protein  27.51 
 
 
366 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4376  putative lipoprotein  29.96 
 
 
315 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4282  putative cytoplasmic protein  27.51 
 
 
366 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4321  hypothetical protein  27.18 
 
 
366 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.932757  normal  0.276393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4253  hypothetical protein  27.51 
 
 
366 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3294  hypothetical protein  35.64 
 
 
330 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3293  hypothetical protein  27.38 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4275  putative inner membrane lipoprotein  26.22 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4366  hypothetical protein  25.52 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4320  hypothetical protein  26.22 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.191931  normal  0.491467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4431  putative inner membrane lipoprotein  26.22 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362505  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6189  hypothetical protein  38.13 
 
 
395 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.568849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>