26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4286 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_4088  putative lipoprotein  95.73 
 
 		 351 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03730  hypothetical protein  95.73 
 
 		 351 aa  674    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4124  putative lipoprotein  95.73 
 
 		 351 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4426  putative lipoprotein  95.44 
 
 		 346 aa  661    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4121  hypothetical protein  95.73 
 
 		 351 aa  674    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4286  putative lipoprotein  100 
 
 		 351 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5347  putative lipoprotein  97.15 
 
 		 351 aa  682    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03781  hypothetical protein  95.73 
 
 		 351 aa  674    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4376  putative lipoprotein  94.9 
 
 		 315 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4282  putative cytoplasmic protein  67.49 
 
 		 366 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4321  hypothetical protein  66.94 
 
 		 366 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.932757  normal  0.276393 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4433  hypothetical protein  66.94 
 
 		 366 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4253  hypothetical protein  67.21 
 
 		 366 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4367  hypothetical protein  67.21 
 
 		 366 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4366  hypothetical protein  36.13 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4320  hypothetical protein  35.98 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.191931  normal  0.491467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4275  putative inner membrane lipoprotein  35.98 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4431  putative inner membrane lipoprotein  35.98 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0390  hypothetical protein  36.41 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.947707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2469  hypothetical protein  38.77 
 
 		 354 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3294  hypothetical protein  33.81 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3293  hypothetical protein  28.37 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4275  hypothetical protein  27.99 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6189  hypothetical protein  29.18 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4276  hypothetical protein  38.71 
 
 		 88 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02296  hypothetical protein  26.72 
 
 		 134 aa  46.2  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>