28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2469 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2469  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  728    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0390  hypothetical protein  39.1 
 
 
339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.947707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5347  putative lipoprotein  38.28 
 
 
351 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4426  putative lipoprotein  38.23 
 
 
346 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4088  putative lipoprotein  38.57 
 
 
351 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03781  hypothetical protein  38.57 
 
 
351 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4121  hypothetical protein  38.57 
 
 
351 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4124  putative lipoprotein  38.57 
 
 
351 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03730  hypothetical protein  38.57 
 
 
351 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4286  putative lipoprotein  37 
 
 
351 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4253  hypothetical protein  35.6 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4433  hypothetical protein  35.16 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696771  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4321  hypothetical protein  35.16 
 
 
366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.932757  normal  0.276393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4282  putative cytoplasmic protein  35.16 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4367  hypothetical protein  35.16 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4376  putative lipoprotein  37.84 
 
 
315 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3294  hypothetical protein  34.48 
 
 
330 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4366  hypothetical protein  32.76 
 
 
343 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4320  hypothetical protein  32.97 
 
 
343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.191931  normal  0.491467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4275  putative inner membrane lipoprotein  32.97 
 
 
343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4431  putative inner membrane lipoprotein  32.97 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362505  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4275  hypothetical protein  33.8 
 
 
317 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6189  hypothetical protein  31.82 
 
 
395 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3293  hypothetical protein  28.94 
 
 
321 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1342  hypothetical protein  25.49 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02296  hypothetical protein  32 
 
 
134 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2517  hypothetical protein  23.91 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267208  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4276  hypothetical protein  33.7 
 
 
88 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>