26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4426 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_4088  putative lipoprotein  96.01 
 
 		 351 aa  678    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03730  hypothetical protein  96.01 
 
 		 351 aa  678    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4124  putative lipoprotein  96.01 
 
 		 351 aa  678    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4426  putative lipoprotein  100 
 
 		 346 aa  714    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4121  hypothetical protein  96.01 
 
 		 351 aa  678    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4286  putative lipoprotein  95.44 
 
 		 351 aa  668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5347  putative lipoprotein  94.59 
 
 		 351 aa  669    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03781  hypothetical protein  96.01 
 
 		 351 aa  678    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4376  putative lipoprotein  98.38 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4282  putative cytoplasmic protein  66.39 
 
 		 366 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4253  hypothetical protein  66.94 
 
 		 366 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4367  hypothetical protein  66.39 
 
 		 366 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4321  hypothetical protein  66.67 
 
 		 366 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.932757  normal  0.276393 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4433  hypothetical protein  66.67 
 
 		 366 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4366  hypothetical protein  35.8 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4320  hypothetical protein  35.34 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.191931  normal  0.491467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4275  putative inner membrane lipoprotein  35.34 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4431  putative inner membrane lipoprotein  35.34 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0390  hypothetical protein  37.5 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.947707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2469  hypothetical protein  39.49 
 
 		 354 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3294  hypothetical protein  34.16 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3293  hypothetical protein  27.66 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4275  hypothetical protein  28.77 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6189  hypothetical protein  27.59 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4276  hypothetical protein  37.63 
 
 		 88 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02296  hypothetical protein  26.72 
 
 		 134 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>