27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4282 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4433  hypothetical protein  99.18 
 
 
366 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696771  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4367  hypothetical protein  99.73 
 
 
366 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4321  hypothetical protein  98.91 
 
 
366 aa  747    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.932757  normal  0.276393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4253  hypothetical protein  98.63 
 
 
366 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4282  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
366 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4121  hypothetical protein  66.94 
 
 
351 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4124  putative lipoprotein  66.94 
 
 
351 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03781  hypothetical protein  66.94 
 
 
351 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03730  hypothetical protein  66.94 
 
 
351 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4088  putative lipoprotein  66.94 
 
 
351 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5347  putative lipoprotein  66.39 
 
 
351 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4286  putative lipoprotein  66.39 
 
 
351 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4426  putative lipoprotein  65.3 
 
 
346 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4376  putative lipoprotein  65.65 
 
 
315 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4366  hypothetical protein  36.14 
 
 
343 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4320  hypothetical protein  35.6 
 
 
343 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.191931  normal  0.491467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4275  putative inner membrane lipoprotein  35.6 
 
 
343 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4431  putative inner membrane lipoprotein  35.6 
 
 
343 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362505  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0390  hypothetical protein  37.54 
 
 
339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.947707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2469  hypothetical protein  36.1 
 
 
354 aa  162  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3294  hypothetical protein  31.25 
 
 
330 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3293  hypothetical protein  25.53 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4275  hypothetical protein  26.76 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0688931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6189  hypothetical protein  24.1 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02296  hypothetical protein  27.48 
 
 
134 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1342  hypothetical protein  23.56 
 
 
352 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4276  hypothetical protein  32.97 
 
 
88 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>