43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5223 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5223  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  822    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4548  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1295  multidrug transporter  25.55 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  31.76 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1356  major facilitator family transporter  25.55 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.21 
 
 		 535 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.29 
 
 		 685 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.19 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  28 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 500 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.19 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.19 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.19 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  28.87 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.19 
 
 		 416 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09316  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05010)  34.74 
 
 		 670 aa  46.6  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.331282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.19 
 
 		 416 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.19 
 
 		 416 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.19 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.21 
 
 		 641 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.19 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  28 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  26.72 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.19 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 		 607 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.61 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  30.4 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.72 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23.66 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.68 
 
 		 555 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 494 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.74 
 
 		 615 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 		 562 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 434 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>