16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2744 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2744  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2822  hypothetical protein  99.71 
 
 		 341 aa  656    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2913  hypothetical protein  92.62 
 
 		 299 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6453  membrane protein  36.55 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0751  hypothetical protein  38.71 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.890953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0717  hypothetical protein  39.02 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2137  hypothetical protein  39.3 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.923537  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0755  hypothetical protein  38.03 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4466  membrane protein  35.44 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1738  hypothetical protein  35.4 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44190  membrane protein  38.92 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1712  hypothetical protein  36.59 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5667  putative transmembrane protein  25.8 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1905  membrane protein  21.69 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0451788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2396  putative transmembrane protein  28.48 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296923  decreased coverage  0.00231835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4162  hypothetical protein  21.9 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>