17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2137 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2137  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.923537  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6453  membrane protein  58.91 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1738  hypothetical protein  59.1 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0751  hypothetical protein  56.27 
 
 		 340 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.890953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1712  hypothetical protein  59.69 
 
 		 354 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4466  membrane protein  55.21 
 
 		 336 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0717  hypothetical protein  56.77 
 
 		 340 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0755  hypothetical protein  55.81 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44190  membrane protein  60.65 
 
 		 347 aa  272  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2822  hypothetical protein  38.51 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2744  hypothetical protein  38.51 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2913  hypothetical protein  40.51 
 
 		 299 aa  159  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4162  hypothetical protein  27.43 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1905  membrane protein  24.76 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0451788  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5667  putative transmembrane protein  23.37 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1217  hypothetical protein  23.85 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394843  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2396  putative transmembrane protein  25.09 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296923  decreased coverage  0.00231835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>