17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4466 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4466  membrane protein  100 
 
 		 336 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0751  hypothetical protein  84.5 
 
 		 340 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.890953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0717  hypothetical protein  83.89 
 
 		 340 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0755  hypothetical protein  84.73 
 
 		 338 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6453  membrane protein  55.06 
 
 		 348 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1738  hypothetical protein  55.79 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1712  hypothetical protein  54.97 
 
 		 354 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2137  hypothetical protein  55.52 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.923537  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44190  membrane protein  57.53 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2744  hypothetical protein  36.92 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2822  hypothetical protein  36.62 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2913  hypothetical protein  36.08 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5667  putative transmembrane protein  26.59 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2396  putative transmembrane protein  27.75 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296923  decreased coverage  0.00231835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4162  hypothetical protein  24.55 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1905  membrane protein  20.85 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0451788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1217  hypothetical protein  23.8 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>