17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1738 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1738  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1712  hypothetical protein  68.81 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6453  membrane protein  63.17 
 
 		 348 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2137  hypothetical protein  59.1 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.923537  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0751  hypothetical protein  55.86 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.890953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4466  membrane protein  55.52 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0717  hypothetical protein  55.41 
 
 		 340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0755  hypothetical protein  53.56 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44190  membrane protein  58.72 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2744  hypothetical protein  35.4 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2822  hypothetical protein  35.09 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2913  hypothetical protein  34.42 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4162  hypothetical protein  24.24 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5667  putative transmembrane protein  25.79 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1217  hypothetical protein  23.55 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394843  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2396  putative transmembrane protein  25.44 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296923  decreased coverage  0.00231835 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1905  membrane protein  20.86 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0451788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>