17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6453 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6453  membrane protein  100 
 
 		 348 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1738  hypothetical protein  63.17 
 
 		 349 aa  348  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1712  hypothetical protein  63.27 
 
 		 354 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2137  hypothetical protein  58.91 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.923537  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0751  hypothetical protein  56.83 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.890953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4466  membrane protein  56.07 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0717  hypothetical protein  57.01 
 
 		 340 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0755  hypothetical protein  57.45 
 
 		 338 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44190  membrane protein  57.4 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2744  hypothetical protein  36.55 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2822  hypothetical protein  35.59 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2913  hypothetical protein  36.4 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5667  putative transmembrane protein  25.23 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1905  membrane protein  23.95 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0451788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2396  putative transmembrane protein  26.79 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296923  decreased coverage  0.00231835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4162  hypothetical protein  26.18 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1217  hypothetical protein  23.94 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>