15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44190 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_44190  membrane protein  100 
 
 		 347 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6453  membrane protein  57.4 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0751  hypothetical protein  57.49 
 
 		 340 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.890953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1738  hypothetical protein  58.72 
 
 		 349 aa  318  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2137  hypothetical protein  60.65 
 
 		 341 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.923537  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4466  membrane protein  57.37 
 
 		 336 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0717  hypothetical protein  57.14 
 
 		 340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0755  hypothetical protein  56.25 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1712  hypothetical protein  58.93 
 
 		 354 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2822  hypothetical protein  39.47 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2744  hypothetical protein  39.17 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2913  hypothetical protein  40.21 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4162  hypothetical protein  26.63 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5667  putative transmembrane protein  28.45 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2396  putative transmembrane protein  28.61 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296923  decreased coverage  0.00231835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>