10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5667 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5667  putative transmembrane protein  100 
 
 		 342 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2396  putative transmembrane protein  69.12 
 
 		 342 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296923  decreased coverage  0.00231835 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6453  membrane protein  25.23 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4162  hypothetical protein  26.17 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1905  membrane protein  23.05 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0451788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0252  hypothetical protein  21.79 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0751  hypothetical protein  28.36 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.890953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1217  hypothetical protein  26.59 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1738  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4466  membrane protein  27.04 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>