9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4162 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4162  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1905  membrane protein  26.52 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0451788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1217  hypothetical protein  29.97 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1738  hypothetical protein  24.24 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5667  putative transmembrane protein  25.62 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6453  membrane protein  25.18 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.127373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2137  hypothetical protein  27.03 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.923537  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44190  membrane protein  27.59 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1771  hypothetical protein  27.21 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>