13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1247 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1247  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2057  hypothetical protein  47.33 
 
 
275 aa  249  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6324  hypothetical protein Ymh  47.67 
 
 
269 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7740  hypothetical protein  47.45 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7042  hypothetical protein  46.3 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.864143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3673  hypothetical protein  45.22 
 
 
235 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1843  hypothetical protein  50.47 
 
 
109 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.118163  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1844  putative protein Ymh  41.45 
 
 
154 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11317  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3620  hypothetical protein  34.97 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0547627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3485  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5286  hypothetical protein  32.58 
 
 
375 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000747572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2250  hypothetical protein  35.29 
 
 
246 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1704  hypothetical protein  31.86 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.286596  normal  0.180371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>