11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2057 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2057  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  566  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7740  hypothetical protein  47.33 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1247  hypothetical protein  47.33 
 
 		 272 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7042  hypothetical protein  46.21 
 
 		 268 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.864143  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6324  hypothetical protein Ymh  46.92 
 
 		 269 aa  244  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3673  hypothetical protein  44.87 
 
 		 235 aa  206  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1843  hypothetical protein  51.82 
 
 		 109 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.118163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1844  putative protein Ymh  31.47 
 
 		 154 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3620  hypothetical protein  28.19 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3485  hypothetical protein  33.63 
 
 		 229 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5286  hypothetical protein  26.87 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000747572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>