11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6324 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6324  hypothetical protein Ymh  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7740  hypothetical protein  63.12 
 
 		 268 aa  337  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7042  hypothetical protein  61.6 
 
 		 268 aa  325  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.864143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3673  hypothetical protein  59.57 
 
 		 235 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2057  hypothetical protein  46.92 
 
 		 275 aa  244  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1247  hypothetical protein  47.67 
 
 		 272 aa  241  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1843  hypothetical protein  49.07 
 
 		 109 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.118163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1844  putative protein Ymh  36.43 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3620  hypothetical protein  30.08 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3485  hypothetical protein  32.23 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2250  hypothetical protein  25.55 
 
 		 246 aa  42.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>