11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3485 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3485  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3620  hypothetical protein  28.99 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547627 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5286  hypothetical protein  35.83 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000747572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2315  hypothetical protein  45.24 
 
 		 84 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0538179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1247  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7740  hypothetical protein  33.06 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7042  hypothetical protein  33.06 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.864143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3673  hypothetical protein  31.3 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2250  hypothetical protein  34.13 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2057  hypothetical protein  33.63 
 
 		 275 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6324  hypothetical protein Ymh  32.23 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>