12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3620 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3620  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3485  hypothetical protein  28.99 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1247  hypothetical protein  34.97 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3673  hypothetical protein  31.17 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2250  hypothetical protein  32.8 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5286  hypothetical protein  31.97 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000747572  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7042  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.864143  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7740  hypothetical protein  30.77 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2057  hypothetical protein  28.19 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6324  hypothetical protein Ymh  30.08 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1843  hypothetical protein  34.04 
 
 		 109 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.118163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1704  hypothetical protein  25.93 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.286596  normal  0.180371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>