25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3117 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3117  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0668  hypothetical protein  86.18 
 
 		 217 aa  387  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3673  hypothetical protein  86.18 
 
 		 217 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.489963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3856  hypothetical protein  86.18 
 
 		 217 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0717  hypothetical protein  86.18 
 
 		 217 aa  387  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3730  hypothetical protein  86.18 
 
 		 217 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3783  hypothetical protein  84.79 
 
 		 217 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0112112  hitchhiker  0.000154653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0595  hypothetical protein  85.71 
 
 		 217 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0526  hypothetical protein  85.71 
 
 		 217 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3884  hypothetical protein  84.33 
 
 		 217 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3381  hypothetical protein  84.33 
 
 		 221 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0639  hypothetical protein  84.33 
 
 		 221 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000210069 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0639  hypothetical protein  84.33 
 
 		 221 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000836292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4007  hypothetical protein  84.33 
 
 		 220 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2990  hypothetical protein  85.17 
 
 		 215 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0593  hypothetical protein  81.4 
 
 		 221 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.837907  normal  0.0115721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39060  hypothetical protein  69.01 
 
 		 213 aa  308  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01695  hypothetical protein  55.88 
 
 		 211 aa  254  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2244  hypothetical protein  36 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2617  hypothetical protein  29.21 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4085  hypothetical protein  32.45 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1847  hypothetical protein  27.69 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.619689  normal  0.236674 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1384  hypothetical protein  24.47 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.820724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4477  hypothetical protein  25.54 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4987  hypothetical protein  24.6 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>