25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39060 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_39060  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3783  hypothetical protein  68.75 
 
 
217 aa  309  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0112112  hitchhiker  0.000154653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3117  hypothetical protein  69.01 
 
 
217 aa  308  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3884  hypothetical protein  68.75 
 
 
217 aa  308  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0717  hypothetical protein  68.93 
 
 
217 aa  305  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4007  hypothetical protein  67.79 
 
 
220 aa  297  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0639  hypothetical protein  67.79 
 
 
221 aa  297  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000210069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3381  hypothetical protein  67.79 
 
 
221 aa  297  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0639  hypothetical protein  67.79 
 
 
221 aa  297  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000836292 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0593  hypothetical protein  66.98 
 
 
221 aa  295  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.837907  normal  0.0115721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3673  hypothetical protein  66.83 
 
 
217 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.489963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3856  hypothetical protein  66.83 
 
 
217 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3730  hypothetical protein  66.83 
 
 
217 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0595  hypothetical protein  66.83 
 
 
217 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0668  hypothetical protein  66.83 
 
 
217 aa  293  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0526  hypothetical protein  64.9 
 
 
217 aa  291  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.378933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2990  hypothetical protein  63.94 
 
 
215 aa  287  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01695  hypothetical protein  58.88 
 
 
211 aa  275  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2244  hypothetical protein  39.5 
 
 
207 aa  144  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2617  hypothetical protein  30.29 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1847  hypothetical protein  29.47 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.619689  normal  0.236674 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4085  hypothetical protein  31.09 
 
 
212 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1384  hypothetical protein  22.63 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.820724  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4477  hypothetical protein  25.54 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4987  hypothetical protein  24.48 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>