38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2767 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1609  ATP-NAD/AcoX kinase  97.96 
 
 
392 aa  739    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028789  normal  0.879633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2750  ATP-NAD/AcoX kinase  97.7 
 
 
392 aa  735    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2449  ATP-NAD/AcoX kinase  98.72 
 
 
392 aa  767    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00190699  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1471  ATP-NAD/AcoX kinase  89.89 
 
 
380 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2767  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 
392 aa  775    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000522722  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1483  ATP-NAD/AcoX kinase  90.96 
 
 
380 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18276  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1418  ATP-NAD/AcoX kinase  90.96 
 
 
380 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2844  ATP-NAD/AcoX kinase  98.47 
 
 
392 aa  766    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  decreased coverage  0.0000850764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3077  hypothetical protein  91.22 
 
 
376 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2586  ATP-NAD/AcoX kinase  79.31 
 
 
373 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1640  hypothetical protein  77.33 
 
 
374 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538817  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3015  ATP-NAD/AcoX kinase  76.92 
 
 
374 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00698025  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2414  ATP-NAD/AcoX kinase  75 
 
 
388 aa  552  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0657692  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1539  ATP-NAD/AcoX kinase  75.39 
 
 
393 aa  548  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2157  hypothetical protein  73.26 
 
 
374 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2665  ATP-NAD/AcoX kinase  71.76 
 
 
383 aa  527  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3811  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  57.22 
 
 
387 aa  428  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01171  ATP-NAD/AcoX kinase  56.68 
 
 
382 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.352461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3386  ATP-NAD/AcoX kinase  55.26 
 
 
378 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2519  ATP-NAD/AcoX kinase  48.4 
 
 
371 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58927  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3756  NAD(+)/NADH kinase  47.15 
 
 
381 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44160  putative ATP-NAD kinase  47.43 
 
 
381 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153646  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1160  hypothetical protein  44.07 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7697  ATP-NAD/AcoX kinase  41.02 
 
 
408 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0758  ATP-NAD/AcoX kinase  39.62 
 
 
359 aa  262  8.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  42.28 
 
 
367 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0064  ATP-NAD/AcoX kinase  38.96 
 
 
365 aa  239  8e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0661  ATP-NAD/AcoX kinase  38.03 
 
 
369 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1276  ATP-NAD/AcoX kinase  38.17 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00533564  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0557  ATP-NAD/AcoX kinase  36.7 
 
 
382 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1713  ATP-NAD/AcoX kinase  39.58 
 
 
366 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1387  ATP-NAD/AcoX kinase  36.68 
 
 
386 aa  222  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2335  ATP-NAD/AcoX kinase  39.52 
 
 
352 aa  222  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1705  ATP-NAD/AcoX kinase  35.73 
 
 
351 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2730  ATP-NAD/AcoX kinase  35.51 
 
 
446 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.083356  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2034  ATP-NAD/AcoX kinase  41.04 
 
 
293 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00139093  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2336  ATP-NAD/AcoX kinase  36.1 
 
 
410 aa  203  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1856  ATP-NAD/AcoX kinase  35.41 
 
 
356 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>