38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3756 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3756  NAD(+)/NADH kinase  100 
 
 
381 aa  742    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44160  putative ATP-NAD kinase  94.23 
 
 
381 aa  700    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153646  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2519  ATP-NAD/AcoX kinase  76.96 
 
 
371 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58927  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2157  hypothetical protein  51.65 
 
 
374 aa  355  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2414  ATP-NAD/AcoX kinase  52.47 
 
 
388 aa  354  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0657692  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3386  ATP-NAD/AcoX kinase  50.13 
 
 
378 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1640  hypothetical protein  49.73 
 
 
374 aa  342  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538817  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2665  ATP-NAD/AcoX kinase  47.61 
 
 
383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1483  ATP-NAD/AcoX kinase  49.32 
 
 
380 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18276  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1418  ATP-NAD/AcoX kinase  49.32 
 
 
380 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1471  ATP-NAD/AcoX kinase  48.51 
 
 
380 aa  332  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1539  ATP-NAD/AcoX kinase  48.41 
 
 
393 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3077  hypothetical protein  48.78 
 
 
376 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2586  ATP-NAD/AcoX kinase  48.5 
 
 
373 aa  329  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3015  ATP-NAD/AcoX kinase  48.9 
 
 
374 aa  329  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00698025  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3811  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  46.48 
 
 
387 aa  328  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01171  ATP-NAD/AcoX kinase  46.74 
 
 
382 aa  323  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.352461  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2449  ATP-NAD/AcoX kinase  47.7 
 
 
392 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00190699  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2767  ATP-NAD/AcoX kinase  47.15 
 
 
392 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000522722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1609  ATP-NAD/AcoX kinase  47.15 
 
 
392 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028789  normal  0.879633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2844  ATP-NAD/AcoX kinase  47.15 
 
 
392 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  decreased coverage  0.0000850764 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2750  ATP-NAD/AcoX kinase  46.61 
 
 
392 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1160  hypothetical protein  43.19 
 
 
397 aa  288  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0661  ATP-NAD/AcoX kinase  43.49 
 
 
369 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  44.44 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0758  ATP-NAD/AcoX kinase  40.39 
 
 
359 aa  253  5.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0064  ATP-NAD/AcoX kinase  44.04 
 
 
365 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7697  ATP-NAD/AcoX kinase  45.26 
 
 
408 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1276  ATP-NAD/AcoX kinase  41.38 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00533564  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2335  ATP-NAD/AcoX kinase  44.48 
 
 
352 aa  232  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1713  ATP-NAD/AcoX kinase  41.11 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0557  ATP-NAD/AcoX kinase  35.41 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2034  ATP-NAD/AcoX kinase  45.77 
 
 
293 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00139093  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1705  ATP-NAD/AcoX kinase  36.49 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1387  ATP-NAD/AcoX kinase  37.44 
 
 
386 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2336  ATP-NAD/AcoX kinase  38.46 
 
 
410 aa  186  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1856  ATP-NAD/AcoX kinase  33.24 
 
 
356 aa  177  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2730  ATP-NAD/AcoX kinase  36.23 
 
 
446 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.083356  normal  0.0459934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>