39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3811 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3811  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  100 
 
 
387 aa  782    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3386  ATP-NAD/AcoX kinase  58.29 
 
 
378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2157  hypothetical protein  57.18 
 
 
374 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2767  ATP-NAD/AcoX kinase  57.22 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000522722  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2449  ATP-NAD/AcoX kinase  56.96 
 
 
392 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00190699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2844  ATP-NAD/AcoX kinase  57.22 
 
 
392 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  decreased coverage  0.0000850764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1418  ATP-NAD/AcoX kinase  56.22 
 
 
380 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1483  ATP-NAD/AcoX kinase  56.22 
 
 
380 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18276  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1609  ATP-NAD/AcoX kinase  56.96 
 
 
392 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028789  normal  0.879633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1471  ATP-NAD/AcoX kinase  56.22 
 
 
380 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3077  hypothetical protein  55.96 
 
 
376 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2750  ATP-NAD/AcoX kinase  56.7 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2586  ATP-NAD/AcoX kinase  56.22 
 
 
373 aa  401  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1640  hypothetical protein  56.25 
 
 
374 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538817  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1539  ATP-NAD/AcoX kinase  56.3 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2665  ATP-NAD/AcoX kinase  56.27 
 
 
383 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3015  ATP-NAD/AcoX kinase  54.69 
 
 
374 aa  391  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00698025  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2414  ATP-NAD/AcoX kinase  55.35 
 
 
388 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0657692  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01171  ATP-NAD/AcoX kinase  50.4 
 
 
382 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.352461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44160  putative ATP-NAD kinase  46.48 
 
 
381 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153646  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3756  NAD(+)/NADH kinase  46.48 
 
 
381 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2519  ATP-NAD/AcoX kinase  45.31 
 
 
371 aa  318  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58927  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1160  hypothetical protein  41.84 
 
 
397 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7697  ATP-NAD/AcoX kinase  37.34 
 
 
408 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1276  ATP-NAD/AcoX kinase  38.52 
 
 
382 aa  233  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00533564  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0661  ATP-NAD/AcoX kinase  36.56 
 
 
369 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2335  ATP-NAD/AcoX kinase  36.32 
 
 
352 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  38.89 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0064  ATP-NAD/AcoX kinase  34.58 
 
 
365 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0557  ATP-NAD/AcoX kinase  34.74 
 
 
382 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1713  ATP-NAD/AcoX kinase  36.15 
 
 
366 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1387  ATP-NAD/AcoX kinase  33.5 
 
 
386 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0758  ATP-NAD/AcoX kinase  33.78 
 
 
359 aa  206  5e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2336  ATP-NAD/AcoX kinase  34.2 
 
 
410 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1705  ATP-NAD/AcoX kinase  33.33 
 
 
351 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.481027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1856  ATP-NAD/AcoX kinase  33.15 
 
 
356 aa  176  9e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2034  ATP-NAD/AcoX kinase  33.44 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00139093  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2730  ATP-NAD/AcoX kinase  29.32 
 
 
446 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.083356  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  25.62 
 
 
308 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>