38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1160 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1160  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  800    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1471  ATP-NAD/AcoX kinase  46.13 
 
 		 380 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3077  hypothetical protein  45.62 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1418  ATP-NAD/AcoX kinase  45.88 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1483  ATP-NAD/AcoX kinase  45.88 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18276  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2414  ATP-NAD/AcoX kinase  46.91 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1539  ATP-NAD/AcoX kinase  45.06 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01171  ATP-NAD/AcoX kinase  42.75 
 
 		 382 aa  299  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.352461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2157  hypothetical protein  44.96 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1609  ATP-NAD/AcoX kinase  44.85 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028789  normal  0.879633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2767  ATP-NAD/AcoX kinase  44.07 
 
 		 392 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000522722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3386  ATP-NAD/AcoX kinase  43.59 
 
 		 378 aa  295  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2665  ATP-NAD/AcoX kinase  43.26 
 
 		 383 aa  295  9e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2844  ATP-NAD/AcoX kinase  44.85 
 
 		 392 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  decreased coverage  0.0000850764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3015  ATP-NAD/AcoX kinase  45.1 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00698025  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2449  ATP-NAD/AcoX kinase  44.33 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00190699  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2750  ATP-NAD/AcoX kinase  44.59 
 
 		 392 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1640  hypothetical protein  43.67 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3756  NAD(+)/NADH kinase  43.19 
 
 		 381 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2586  ATP-NAD/AcoX kinase  42.38 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44160  putative ATP-NAD kinase  42.16 
 
 		 381 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2519  ATP-NAD/AcoX kinase  42.67 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58927  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3811  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  41.84 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7697  ATP-NAD/AcoX kinase  38.72 
 
 		 408 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0758  ATP-NAD/AcoX kinase  32.3 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1276  ATP-NAD/AcoX kinase  35.32 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00533564  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  36.55 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0557  ATP-NAD/AcoX kinase  32.56 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0064  ATP-NAD/AcoX kinase  33.25 
 
 		 365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0661  ATP-NAD/AcoX kinase  31.85 
 
 		 369 aa  176  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1856  ATP-NAD/AcoX kinase  32.37 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2034  ATP-NAD/AcoX kinase  39.87 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00139093  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1713  ATP-NAD/AcoX kinase  33.76 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2335  ATP-NAD/AcoX kinase  34.92 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1705  ATP-NAD/AcoX kinase  30.03 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2730  ATP-NAD/AcoX kinase  30.54 
 
 		 446 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.083356  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1387  ATP-NAD/AcoX kinase  31.14 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2336  ATP-NAD/AcoX kinase  30.26 
 
 		 410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>