38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3077 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1609  ATP-NAD/AcoX kinase  91.49 
 
 		 392 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028789  normal  0.879633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2750  ATP-NAD/AcoX kinase  90.96 
 
 		 392 aa  663    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2449  ATP-NAD/AcoX kinase  91.49 
 
 		 392 aa  670    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00190699  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1471  ATP-NAD/AcoX kinase  96.81 
 
 		 380 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2767  ATP-NAD/AcoX kinase  91.22 
 
 		 392 aa  668    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000522722  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1483  ATP-NAD/AcoX kinase  98.4 
 
 		 380 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.18276  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1418  ATP-NAD/AcoX kinase  98.4 
 
 		 380 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2844  ATP-NAD/AcoX kinase  92.02 
 
 		 392 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  decreased coverage  0.0000850764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3077  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  749    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2586  ATP-NAD/AcoX kinase  78.46 
 
 		 373 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1640  hypothetical protein  77.27 
 
 		 374 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.538817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3015  ATP-NAD/AcoX kinase  76.8 
 
 		 374 aa  557  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00698025  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2414  ATP-NAD/AcoX kinase  76.68 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1539  ATP-NAD/AcoX kinase  76.58 
 
 		 393 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2157  hypothetical protein  73.8 
 
 		 374 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2665  ATP-NAD/AcoX kinase  73.44 
 
 		 383 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3811  putative inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  55.96 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3386  ATP-NAD/AcoX kinase  55.79 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01171  ATP-NAD/AcoX kinase  55.35 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.352461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2519  ATP-NAD/AcoX kinase  49.73 
 
 		 371 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.58927  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3756  NAD(+)/NADH kinase  48.78 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44160  putative ATP-NAD kinase  48.51 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1160  hypothetical protein  45.36 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7697  ATP-NAD/AcoX kinase  40.86 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0758  ATP-NAD/AcoX kinase  40.85 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0078  ATP-NAD/AcoX kinase  42.28 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0661  ATP-NAD/AcoX kinase  39.63 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1276  ATP-NAD/AcoX kinase  40.7 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00533564  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0064  ATP-NAD/AcoX kinase  40.11 
 
 		 365 aa  237  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1713  ATP-NAD/AcoX kinase  39.84 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0557  ATP-NAD/AcoX kinase  37.14 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1387  ATP-NAD/AcoX kinase  36.68 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2335  ATP-NAD/AcoX kinase  39.25 
 
 		 352 aa  219  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2730  ATP-NAD/AcoX kinase  36.08 
 
 		 446 aa  215  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.083356  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1705  ATP-NAD/AcoX kinase  36.17 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2034  ATP-NAD/AcoX kinase  41.78 
 
 		 293 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00139093  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2336  ATP-NAD/AcoX kinase  35.63 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1856  ATP-NAD/AcoX kinase  34.96 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>