21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28410 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0945803 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  87.76 
 
 
49 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14080  hypothetical protein  77.55 
 
 
49 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1591  hypothetical protein  58.33 
 
 
581 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  51.06 
 
 
53 aa  60.5  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0089  hypothetical protein  57.14 
 
 
54 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.763011  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1448  hypothetical protein  54.55 
 
 
46 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000871419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1250  hypothetical protein  52.27 
 
 
46 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141622  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0733  hypothetical protein  57.14 
 
 
47 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.818237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4381  hypothetical protein  48.84 
 
 
51 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4115  hypothetical protein  51.22 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68855  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_002936  DET0980  hypothetical protein  43.18 
 
 
57 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0205462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0871  hypothetical protein  43.18 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1767  hypothetical protein  47.92 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  51.22 
 
 
49 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.114976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3734  hypothetical protein  51.22 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210558  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11420  hypothetical protein  45.45 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.929313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0615  hypothetical protein  37.21 
 
 
260 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70319  normal  0.0524669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2466  hypothetical protein  43.75 
 
 
52 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0349233  hitchhiker  0.0000612966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4226  hypothetical protein  40.91 
 
 
50 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0548  hypothetical protein  34.78 
 
 
226 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>