15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1767 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1767  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1520  hypothetical protein  73.08 
 
 
52 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.658158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7936  hypothetical protein  67.31 
 
 
52 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4115  hypothetical protein  72.55 
 
 
55 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68855  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2466  hypothetical protein  65.38 
 
 
52 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0349233  hitchhiker  0.0000612966 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3734  hypothetical protein  72.55 
 
 
55 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210558  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4226  hypothetical protein  67.31 
 
 
50 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1184  hypothetical protein  67.31 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.129862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  67.31 
 
 
49 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.114976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1839  hypothetical protein  62.22 
 
 
225 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11420  hypothetical protein  66 
 
 
52 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.929313  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0936  hypothetical protein  63.46 
 
 
51 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4381  hypothetical protein  60.78 
 
 
51 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  47.92 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0945803 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  50 
 
 
49 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>