17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4226 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4226  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  84 
 
 		 49 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.114976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7936  hypothetical protein  80.77 
 
 		 52 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4381  hypothetical protein  77.55 
 
 		 51 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4115  hypothetical protein  73.47 
 
 		 55 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68855  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3734  hypothetical protein  73.47 
 
 		 55 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2466  hypothetical protein  73.08 
 
 		 52 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0349233  hitchhiker  0.0000612966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0936  hypothetical protein  76 
 
 		 51 aa  77.4  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1839  hypothetical protein  72.34 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1520  hypothetical protein  67.31 
 
 		 52 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.658158  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1767  hypothetical protein  67.31 
 
 		 59 aa  73.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1184  hypothetical protein  65.38 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.129862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11420  hypothetical protein  66 
 
 		 52 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.929313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1628  hypothetical protein  46.34 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0890036  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  41.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1448  hypothetical protein  45.65 
 
 		 46 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000871419  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  40.91 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0945803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>