13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1628 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1628  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  337  5.9999999999999996e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0890036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0548  hypothetical protein  41.94 
 
 
226 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0615  hypothetical protein  38.6 
 
 
260 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70319  normal  0.0524669 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1591  hypothetical protein  37.21 
 
 
581 aa  48.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0089  hypothetical protein  37.78 
 
 
54 aa  45.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.763011  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1448  hypothetical protein  40.48 
 
 
46 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000871419  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  47.5 
 
 
53 aa  45.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4381  hypothetical protein  48.89 
 
 
51 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4226  hypothetical protein  46.34 
 
 
50 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1250  hypothetical protein  38.1 
 
 
46 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  50 
 
 
49 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.114976 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0871  hypothetical protein  44.19 
 
 
57 aa  40.8  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  42.86 
 
 
49 aa  40.8  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>