17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3109 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  100 
 
 
49 aa  98.2  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  87.76 
 
 
55 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0945803 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14080  hypothetical protein  83.67 
 
 
49 aa  85.1  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  56.82 
 
 
53 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1591  hypothetical protein  53.19 
 
 
581 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1448  hypothetical protein  54.35 
 
 
46 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000871419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1250  hypothetical protein  52.17 
 
 
46 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141622  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0089  hypothetical protein  54.17 
 
 
54 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.763011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4115  hypothetical protein  52.38 
 
 
55 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68855  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0733  hypothetical protein  52.38 
 
 
47 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.818237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3734  hypothetical protein  52.38 
 
 
55 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210558  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1767  hypothetical protein  50 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1628  hypothetical protein  42.86 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0890036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0936  hypothetical protein  43.18 
 
 
51 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0871  hypothetical protein  43.18 
 
 
57 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11420  hypothetical protein  45.45 
 
 
52 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.929313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0980  hypothetical protein  43.18 
 
 
57 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0205462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>