16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1591 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1591  hypothetical protein  100 
 
 
581 aa  1105    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  68.09 
 
 
53 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0733  hypothetical protein  55.81 
 
 
47 aa  63.5  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.818237 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  57.14 
 
 
55 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0945803 
 
 
-
 
NC_002936  DET1448  hypothetical protein  48.89 
 
 
46 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000871419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1250  hypothetical protein  48.89 
 
 
46 aa  60.8  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141622  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0089  hypothetical protein  51.02 
 
 
54 aa  60.5  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.763011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14080  hypothetical protein  50 
 
 
49 aa  58.5  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  52.08 
 
 
49 aa  57.4  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0631  hypothetical protein  32.65 
 
 
102 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0871  hypothetical protein  50 
 
 
57 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236449  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0980  hypothetical protein  47.73 
 
 
57 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0205462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1628  hypothetical protein  37.21 
 
 
170 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0890036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  35.93 
 
 
2353 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 
459 aa  44.3  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.22 
 
 
1888 aa  43.5  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>