18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3734 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3734  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4115  hypothetical protein  98.18 
 
 		 55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68855  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4226  hypothetical protein  73.47 
 
 		 50 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4381  hypothetical protein  75 
 
 		 51 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  75.51 
 
 		 49 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.114976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0936  hypothetical protein  72.55 
 
 		 51 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1767  hypothetical protein  72.55 
 
 		 59 aa  73.9  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1839  hypothetical protein  56.6 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7936  hypothetical protein  62.75 
 
 		 52 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1520  hypothetical protein  64.71 
 
 		 52 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.658158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2466  hypothetical protein  66.67 
 
 		 52 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0349233  hitchhiker  0.0000612966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1184  hypothetical protein  64.71 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.129862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11420  hypothetical protein  60.38 
 
 		 52 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.929313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  52.38 
 
 		 49 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  51.22 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0945803 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  52.38 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14080  hypothetical protein  50 
 
 		 49 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0089  hypothetical protein  42 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.763011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>