18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4115 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4115  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68855  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3734  hypothetical protein  98.18 
 
 
55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210558  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4226  hypothetical protein  73.47 
 
 
50 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4381  hypothetical protein  75 
 
 
51 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  75.51 
 
 
49 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.114976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0936  hypothetical protein  72.55 
 
 
51 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1767  hypothetical protein  72.55 
 
 
59 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1839  hypothetical protein  56.6 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7936  hypothetical protein  62.75 
 
 
52 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1520  hypothetical protein  64.71 
 
 
52 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.658158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2466  hypothetical protein  66.67 
 
 
52 aa  67.4  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0349233  hitchhiker  0.0000612966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1184  hypothetical protein  64.71 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.129862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11420  hypothetical protein  60.38 
 
 
52 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.929313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  52.38 
 
 
49 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  51.22 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0945803 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  52.38 
 
 
53 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14080  hypothetical protein  50 
 
 
49 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0089  hypothetical protein  42 
 
 
54 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.763011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>