14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0733 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0733  hypothetical protein  100 
 
 
47 aa  96.3  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.818237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1591  hypothetical protein  55.81 
 
 
581 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1413  hypothetical protein  58.7 
 
 
53 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1250  hypothetical protein  54.55 
 
 
46 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141622  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1448  hypothetical protein  54.55 
 
 
46 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000871419  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28410  hypothetical protein  57.14 
 
 
55 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0945803 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0089  hypothetical protein  52.27 
 
 
54 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.763011  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0871  hypothetical protein  51.11 
 
 
57 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236449  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0980  hypothetical protein  48.89 
 
 
57 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0205462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3109  hypothetical protein  52.38 
 
 
49 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000507516 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14080  hypothetical protein  50 
 
 
49 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1594  hypothetical protein  51.22 
 
 
49 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.114976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4381  hypothetical protein  51.22 
 
 
51 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1628  hypothetical protein  41.03 
 
 
170 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0890036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>