More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09400 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_09400  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  100 
 
 
290 aa  601  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.808435 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1806  riboflavin biosynthesis protein RibF  61.38 
 
 
307 aa  353  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013093  normal  0.250127 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08000  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  55.52 
 
 
309 aa  317  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.428873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14650  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  38.05 
 
 
313 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.79 
 
 
311 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3326  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.76 
 
 
313 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0873807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.74 
 
 
310 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.36 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2161  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.21 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0689935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07880  FMN adenylyltransferase;riboflavin kinase  36.24 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5827  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.93 
 
 
310 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3585  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.97 
 
 
315 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3557  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.42 
 
 
309 aa  168  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1187  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.07 
 
 
309 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0826  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.15 
 
 
345 aa  166  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.908796  hitchhiker  0.00000385978 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.91 
 
 
308 aa  165  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3956  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.93 
 
 
324 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  35.71 
 
 
320 aa  165  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000197835  hitchhiker  0.0000124783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.39 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.52 
 
 
314 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.56 
 
 
311 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1337  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.33 
 
 
309 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107929  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2129  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.12 
 
 
317 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.08 
 
 
313 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1733  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.34 
 
 
320 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.7 
 
 
308 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1379  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.74 
 
 
309 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.672568  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0947  bifunctional protein: riboflavin kinase; FAD synthetase  33.79 
 
 
309 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.22 
 
 
311 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.79 
 
 
318 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000331825  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1837  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.33 
 
 
311 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2214  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.45 
 
 
313 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00156337  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.38 
 
 
312 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0577  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  32.75 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1066  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.95 
 
 
315 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  0.0219323 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0979  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.49 
 
 
306 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2770  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.49 
 
 
317 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4025  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.99 
 
 
307 aa  155  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_002936  DET0602  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.39 
 
 
305 aa  155  8e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00769126  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2304  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  36.49 
 
 
306 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0494  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.72 
 
 
321 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.23 
 
 
311 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_542  FAD synthase  31.82 
 
 
305 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0794866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0492  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  32.31 
 
 
315 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.196365 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14341  putative riboflavin kinase/FAD synthase  31.27 
 
 
307 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1022  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.78 
 
 
315 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11510  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  34.25 
 
 
290 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00384201  normal  0.587346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.91 
 
 
311 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.92 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7738  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.22 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.08 
 
 
309 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1464  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.22 
 
 
325 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  35.99 
 
 
320 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  33.45 
 
 
306 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0957  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.49 
 
 
323 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0600204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3187  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.45 
 
 
310 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0368  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  32.04 
 
 
295 aa  150  3e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0907  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.45 
 
 
324 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2222  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.02 
 
 
321 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12799  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.89 
 
 
331 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23420  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  32.31 
 
 
329 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07060  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  31.58 
 
 
325 aa  149  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0714  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.83 
 
 
369 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.68 
 
 
311 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0641  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.4 
 
 
314 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.967274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2348  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.56 
 
 
324 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400291  hitchhiker  0.00462783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4028  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.03 
 
 
338 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03031  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.21 
 
 
289 aa  148  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0128028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  30.18 
 
 
316 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.99 
 
 
316 aa  148  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0998  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  33.67 
 
 
328 aa  148  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0904  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.37 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1430  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  33.22 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2744  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.59 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2725  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.22 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2336  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.22 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.532241  normal  0.131688 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0817  FAD synthase  32.23 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000828209  normal  0.146112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2118  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  29.64 
 
 
352 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0861  riboflavin biosynthesis protein RibF  31.54 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.204041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0602  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.94 
 
 
316 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0503  riboflavin biosynthesis protein RibF  30.77 
 
 
320 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1675  FMN adenylyltransferase  30.77 
 
 
345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  31.96 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3030  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.89 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2196  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.49 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1367  putative riboflavin kinase/FAD synthase  30.14 
 
 
307 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.413233  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0612  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  33.79 
 
 
314 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.115533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3260  riboflavin biosynthesis protein RibF  29.41 
 
 
356 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0967  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  32.66 
 
 
328 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.56 
 
 
314 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0480  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  31.94 
 
 
355 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.8 
 
 
312 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0643  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  33.57 
 
 
322 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4863  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.75 
 
 
322 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22731  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0988  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.27 
 
 
333 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000335152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2234  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.12 
 
 
317 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  31.96 
 
 
309 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.22 
 
 
333 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0510646  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2081  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  34.25 
 
 
333 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  0.190506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3260  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  33.81 
 
 
307 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.853112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>