22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01230  Na+/melibiose symporter-like transporter  100 
 
 		 435 aa  866    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1203  major facilitator superfamily MFS_1  68.87 
 
 		 457 aa  546  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  0.147172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1592  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 435 aa  252  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.241693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3322  hypothetical protein  36.57 
 
 		 429 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1731  hypothetical protein  28.79 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  26 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.6 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1700  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  26.83 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>