12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1203 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1203  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 457 aa  903    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  0.147172 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01230  Na+/melibiose symporter-like transporter  68.87 
 
 		 435 aa  566  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3322  hypothetical protein  39.74 
 
 		 429 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1592  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 435 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.241693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1731  hypothetical protein  28.57 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00706224  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1700  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  26.87 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 391 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 403 aa  46.6  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>